Ceny BMW E60 na rynku wtórnym są bardzo rozbieżne. Generalnie wartość rynkową konkretnego egzemplarza E60 możemy wyliczyć ze wzoru:
Cena E60 = cena samochodu + cena silnika
Nie które silniki posiadają wartość ujemną a niektóre dodatnią.
Najtańsze są BMW 520d
Silnik 2.0 diesel to jednostka, która posiada w E60 zdecydowanie wartość ujemną. Samochody, w których znajduje się ta jednostka napędowa są znacznie tańsze niż inne wersje silnikowe E60. Wynika to z faktu niskiej kultury pracy tego silnika i wysokich kosztów ewentualnych napraw. Złośliwi fani marki twierdzą, że więcej są warte E60 bez silnika niż z 2.0 dieslem pod maską gdyż od jego drgań rozklekotuje się tapicerka i pękają uszczelki szyb.